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南京農大粟碩教授等大數據分析冠狀病毒進化與重組

  文章出處:江蘇科晶 點擊次數: ;     更新時間:2023-04-21

2016年3月21日,國際學術權威刊物《Cell》旗下子刊《Trends in Microbiology》在線發表了題為“Epidemiology, Genetic Recombination, and Pathogenesis of Coronaviruses”的論文。該文章第一作者和通訊作者為南京農業大學動物醫學院長江學者周繼勇團隊的粟碩教授,共同通訊作者為中國科學院青年傳染病專家畢玉海副研究員和中國科學院高福院士。

冠狀病毒(CoV)感染主要引起呼吸系統(雞傳染性支氣管炎病毒、犬冠狀病毒)和消化系統疾病(豬傳染性胃腸炎病毒、牛腹瀉病毒、犬冠狀病毒、貓冠狀病毒等)。人的冠狀病毒感染同樣以呼吸系統疾病和消化道疾病為主要特征,但疾病發生程度有很大差異。到目前為止,主要感染人的冠狀病毒有6種:229E、OC43、NL63、 HKU1、非典型肺炎病毒SARS-CoV和中東呼吸熱綜合征病毒(MERS-CoV)。

其中SRAS-CoV在2003年引起了8273人感染,包括775人死于該疾病。MERS-CoV是2014年又一次爆發,截止到2015年12月31日,該病毒引起1621人感染,584人死亡,成為對人威脅和危害性極大的疾病之一。盡管MERS病毒目前仍然是有限的人傳人的能力,但是仍需要監控其重組和進化,以防止其一旦適應人類后造成的潛在的大流行。

針對目前MERS等冠狀病毒復雜的流行情況和快速的重組等特點,這篇文章利用先進的生物信息學分析方法從流行病學調查、發病機理、進化和重組情況等方面對不同的冠狀病毒進行了比較分析,并且用大數據網絡監測和分析病毒序列預測了存在潛在威脅的動物源性重組冠狀病毒,文章最后針對MERS,SARS等冠狀病毒的頻繁重組提出了具體防控建議。該論文也是南京農業大學青年傳染病專家粟碩教授繼柳葉刀雜志回溯流行病學分析MERS病例輸入中國之后,再一次在高水平權威期刊發表關于MERS等新發傳染病流行病學的論文。


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